Na początku Mszy św. kardynał podziękował za zaproszenie do wspólnej modlitwy. Zauważył, że katedra wawelska w sposób szczególny przechowuje pamięć o Wiktorii Wiedeńskiej, ponieważ w jej podziemiach znajduje się grób Jana III Sobieskiego. Powitał wszystkich zebranych i przypomniał, że dziś Kościół obchodzi święto Podwyższenia Krzyża Świętego. – Wpatrując się w krzyż, na którym Jezus oddał życie dla zbawienia świata, pragniemy spojrzeć na wielkie wydarzenia naszej zbiorowej historii, a także na osobistą drogę życia każdej i każdego z nas – zaznaczył.

– Wiszący na krzyżu Syn Boży przyjął dobrowolnie tę okrutną śmierć. Będąc Bogiem, stał się człowiekiem. Stał się jednym z nas, utożsamiając się z niełatwym losem człowieka – wskazał kardynał w homilii i zauważył, że swoją odkupieńcza śmiercią i zmartwychwstaniem Jezus odniósł zwycięstwo nad złem i otworzył ludziom drogę od życia.

– Ostateczne wyjaśnienie dramatu krzyża zawiera się w jednym słowie – „miłość”. Tę prawdę potwierdził Jezus w dzisiejszej Ewangelii – stwierdził kardynał. Powiedział, że tej miłości, która odniosła ostateczne zwycięstwo, ludzie zawdzięczają swe życie. – Przychodzimy dziś do Chrystusa, by wyrazić wdzięczność za wszystko czego dokonał dla nas i dla ocalenia naszego losu. Jako uczniowie Ukrzyżowanego i Zmartwychwstałego Pana wierzymy, że nasze życie i przyszłość jest w ręku Boga-Zbawcy, który nas nigdy nie opuści. Zapłacił za nas wielką cenę krwi, dlatego zawsze będzie z nami – podkreślił.

Zauważył, że w życiu osobistym, rodzinnym i społecznym najbardziej potrzebna jest miłość. To na niej należy budować dom życia. Znakiem największej miłości i ofiary Syna Bożego jest krzyż. – Krzyż stał się symbolem najwyższych wartości naszego życia: ofiarności, gotowości poświęcenia życia dla ważnej sprawy, bezinteresownej służby – mówił kardynał. Wskazał, że krzyże umieszczone w przestrzeni publicznej mają przypominać o nieskończonej i ofiarnej miłości Boga do człowieka.

Krzyż towarzyszył także królowi Janowi III Sobieskiemu i jego wojskom, które podjęły walkę o wiarę i wolność Polski oraz Europy. Król wierzył, że przy pomocy Opatrzności jest w stanie zwyciężyć. Kardynał przywołał słowa Sobieskiego, które skierował do swych podkomendnych. Król mówił, że wszyscy walczą za Polskę i chrześcijaństwo, nie za cesarza, lecz za Boga. Wiktoria Wiedeńska podnosiła wszystkich na duchu, a pamięć o tym wydarzeniu miała budować szkołę im. Jana III Sobieskiego w Krakowie. – Każdy jubileusz szkoły jest dumą dla nauczycieli i uczniów, pracowników i absolwentów. Każdy jubileusz skłania także do refleksji nad historią tylu pokoleń nauczycieli i uczniów, którzy przeszli przez II Krakowskie Liceum Ogólnokształcące, które ich przygotowało do życia – podkreślił kardynał. Przypomniał, że uczniowie tej szkoły byli gotowi zawsze oddać życie za ojczyznę. Lista wybitnych absolwentów tej szkoły jest bardzo długa i trudno byłoby ich wszystkich wymienić. – Król Jan III Sobieski jest dobrym przykładem dla tych, którzy chcą walczyć i zwyciężać. Mamy dążyć do zwycięstwa dobra nad złem, miłości nad nienawiścią, mamy przezwyciężać słabość i umacniać wolę. W tym dążeniu wymiar religijny jest zasadniczy, abyśmy rzeczywiście spełnili każde zadanie, które nam powierzono – podkreślił kardynał. Stwierdził, że wzorem takiej postawy jest także Karol Wojtyła, który inspirując się wielkimi postaciami naszej historii, stawiając sobie wysokie cele i odpowiadając na głos Jezusa, podjął służbę w Kościele. Jako papież stał się on przewodnikiem milionów chrześcijan na całym świecie.

Na zakończenie homilii kardynał pogratulował dyrekcji, gronu pedagogicznemu i uczniom II Liceum Ogólnokształcącego pięknego jubileuszu i wspaniałych osiągnięć. Powiedział, że wraz z nimi modli się za nauczycieli i uczniów, by z Bożą pomocą wypełniali dalsze zadania i pomnażali dobro w świecie.

Msza św. na Wawelu, której przewodniczył kard. Stanisław Dziwisz, została odprawiona w ramach zakończenia ogólnopolskich obchodów Jubileuszu 160-lecia Powstania Styczniowego. Częścią obchodów była uroczystość 340. Rocznicy Wiktorii Wiedeńskiej oraz Jubileusz 140-lecia założenia Liceum im. Króla Jana III Sobieskiego w Krakowie. Po Mszy św. złożono kwiaty przy grobie króla Jana III Sobieskiego w krypcie św. Leonarda. Następnie miał miejsce przemarsz pod Krzyż Katyński, gdzie odbyło się ślubowanie 300 uczniów klas pierwszych II Liceum Ogólnokształcącego im. Króla Jana III Sobieskiego oraz apel pamięci, po którym złożono pod krzyżem kwiaty.