Fundacja, ustanowiona papieskim dekretem 16 października 1981 r., ma charakter międzynarodowy. Liczy 44 Koła i Towarzystwa Przyjaciół Fundacji w 16 krajach świata. Realizują one cele, które postawił przed nimi Jan Paweł II. Fundacja ma popierać i realizować inicjatywy o charakterze edukacyjnym, naukowym, kulturalnym, religijnym i charytatywnym, związane z pontyfikatem Papieża-Polaka. M.in. prowadzi Ośrodek Dokumentacji Pontyfikatu Jana Pawła II i sponsoruje program stypendialny dla studentów z Europy Wschodniej.

– Jedna z form działalności Papieskiej Fundacji to pomoc i kształcenie młodzieży z Europy Wschodniej – wyjaśnia kard. Dziwisz. – Jak słyszałem wczoraj od dyrektora Domu Studentów naszej Fundacji w Lublinie, już przeszło 900 osób ukończyło studia ze stopniem magistra, a 80 ze stopniem doktora. To jest duże osiągnięcie. Ale też jest praca związana z kontaktami naukowymi, wymiana kulturalna. Od samego początku Ojcu Świętemu Janowi Pawłowi II bardzo zależało, by była wymiana między Wschodem a Zachodem. Chciał takiej struktury, żeby się to odbywało. Trzeba było poszukać miejsca i znalazłszy je stworzyliśmy Dom Polski. W ten sposób powstała rzymska Fundacja. Nazwaliśmy ją potem Fundacją Jana Pawła II – podsumowuje metropolita krakowski.